國立屏東科技大學獸醫教學醫院溯自日治時期本校前身屏東農業學校之家畜病院，當時診治對象以馬為主，故又稱馬病舍，主要為畜產科學生實習場所，未對外接診。1945年改稱家畜診療所，1950年改建並更名家畜醫院開始對外接診。1969年，家畜醫院於屏東農業專科學校北校區新建二層鋼筋水泥大樓，有內、外科診療室、X光室、手術室，教室及實驗室。1986年遷校內埔，1987年新建動物醫療院所，於1988年完工並更名動物醫院。2017年特更名為獸醫教學醫院。